药物治疗首选β受体阻滞剂、非二氢吡啶类的钙通道阻滞剂降低心率，增加心室充盈时间，最终使心脏效率增加，改善机体缺血缺氧症状。非药物治疗主要是针对合并流出道梗阻的肥厚型心肌病，对于药物治疗无效的可考虑行室间隔切除术、酒精室间隔消融术、右室心尖起搏治疗等多种方法。肥厚性心肌病的治疗原则是改善症状，减少并发症。如果患者出现房颤、栓塞等并发症时，也要使用药物抗凝等对症治疗。

肥厚性心肌病的治疗目前并没有什么特效的药物，主要就是在医生的指导下应用一些β受体阻断剂，比如心得安治疗，可以有效的减轻左心室流出道梗阻，改善左心室室壁的顺应性以及左心室的充盈，比较严重的可以采取手术的方法进行治疗。肥厚型心肌病，多发生在30岁到40岁的成年人。随着年龄的增长临床上可能会表现为呼吸困难，还可以出现心绞痛。如果合并比较严重的二尖瓣关闭不全，可以进行二尖瓣置换手术，这种疾病发展比较缓慢，预后比较好。

对于梗阻性心肌病的患者，如果说左室流出的压差超过50毫米汞柱以上，建议选择酒精射频消融术，或者说是外科手术治疗，来使来左室流出道的压差降低。如果说压差比较小，比如说在小于20毫米汞柱以下，这种情况下其还不是特别严重，但是说如果压差超过50毫米汞柱，则风险是比较大的，很容易患者出现反复的呼吸困难、晕厥、心前区疼痛、心衰等表现。肥厚性梗阻性心肌病的严重程度，主要根据左室流出道压差来判定的。有些人群由于严重的恶性心律失常，或者说心功能的改变，以及摄取量的降低，会导致猝死的发生。