如果慢性结肠炎反复发作，非手术治疗无效，还可以行手术彻底的根除此病，可以行全结肠切除加回肠直肠吻合术，也可以行全结直肠切除加回肠肛管吻合术，不同的结肠炎类型及范围，选择不同的手术方式。对症的治疗，如腹泻的给予蒙脱石散剂止泻处理的；如果得了慢性结肠炎，应当积极的进行饮食调理，避免辛辣刺激的食物，避免饮酒抽烟，应当多吃一些粗粮及粗纤维的食物。

目前在临床上的应用也逐渐广泛，对于它的方剂或者是具体的配方，并没有一个严格的限定的标准，目前在临床上是病人经过中医师专科检查以后，根据病人体质特点以及病情严重程度进行方剂的调配，总体原则上药物治疗还是以缓解病人的症状，控制病情的进展为主。结肠炎主要是各种原因引起的结肠炎症性病变，致病因素有很多种，病变部位多位于乙状结肠，病程漫长而常有反复发作，在治疗上要进行辨证论治，根据病人的症状，可以分为以下几种。结肠炎在临床上的病原体多见于细菌，还与病毒等病原体感染有关。

比如说：急性结肠炎，在临床上特别多见，主要是吃了不干净的食物引起，主要的临床表现为恶心，呕吐，腹胀，腹痛，腹泻，有时候还会伴有发热，但是病程比较短。腹泻也是结肠炎的患者常见的症状，由于胃肠道蠕动过快，食物摄入后不能被消化和吸收就会被快速排出，所以患者容易出现水样便、粘液便，症状严重时还会出现粘液血便等表现；过敏性结肠炎可能伴随有腹痛、腹泻、腹部不适、皮疹等，可以伴有血常规中嗜酸性粒细胞的升高，还可以伴有胃肠镜检查病理结果提示大量的嗜酸性粒细胞浸润。