前列腺穿刺术最大的危害就是出血，因为穿刺会有多点多个部位，经直肠穿刺有可能导致直肠出血，也可能导致前列腺出血，对于前列腺穿刺出血，穿刺针术前必须停用抗凝抗血小板聚集的药物，术前应该评估血常规和凝血功能，穿刺时必须精准定位，尽量避开尿道和膀胱，合理选择穿刺的针速以及穿刺的路径。如果患者为了诊断这种前列腺的疾病，这时则采用前列腺穿刺术来进行摘取这种前列腺的病变部位，这种情况下在前列腺穿刺术后一定要注意及时的进行预防感染等对症治疗。大多数的医院采取经直肠前列腺的穿刺活检，因为直肠有些粪便容易污染，导致感染，所以在穿刺之前也要做肠道的准备。

如果患者行腰椎穿刺，取脑脊液检查，穿刺完毕后，患者必须要去枕平卧休息，同时可以适当的摄取水分或者静脉输液补充血容量，防止穿刺后出现头痛、头晕、恶心、呕吐等并发症。肝穿的注意事项包括：有出血倾向、大量腹水、肝包虫病、肝血管瘤、右侧脓胸、膈下脓疡性黄疸的病人及不合作者，应禁忌肝穿刺。最常见的是胆囊，因为肝胆相照，胆囊在肝上附着，在肝穿刺的过程中，有可能会引起胆囊的损伤，会引起胆汁瘘，漏到腹腔里面。

肾穿刺活检常见的危害主要有以下几方面：首先患者可能会出现穿刺点周围的皮肤感染，或者穿刺的肾脏发生感染等情况；肺部肿瘤穿刺活检有一定的危险性，主要的风险有气胸，出血，胸膜反应，针道肿瘤种植。细菌学检查可以明确是什么细菌所导致的肺脓肿，比如说金葡萄球菌，链球菌，绿脓杆菌等都有可能，所以一定要做穿刺，然后做细菌学培养。