自闭症有可能是大脑结构出现了问题，比如小脑发育不良、杏仁核异常、脑脊液增多等。

1、小脑发育不良：自闭症患者在通过颅脑核磁共振检查以及CT检查时，可观察到小脑部分脑组织有发育不良的迹象。

2、杏仁核异常：自闭症患者的杏仁核通常会比正常人群的杏仁核个体小。部分自闭症患者合并焦虑症的情况下，还会出现萎缩的现象。

3、脑脊液增多：部分被诊断出患有自闭症的儿童，脑脊液会出现明显增多的情况，还可能会导致头部异常增大。

除了上述病变外，少数患者还可出现海马体萎缩、侧脑室扩大、胼胝体萎缩等改变。