一般建议病人服用两周以后停药四周，再进行幽门螺杆菌的相关的检测，如果转变成阴性了，幽门螺杆菌相关性胃炎就临床痊愈了。对于幽门螺杆菌相关性胃炎，针对幽门螺杆菌进行治疗以后，病人胃炎的相关症状都会消失。抗幽门螺杆菌治疗临床上目前是四联疗法，首先一种是质子泵抑制剂加上两种抗生素，再加上一种铋剂，疗程一般是两周。幽门螺旋杆菌相关性胃炎一般必须先进行抗幽门螺杆菌的治疗。

采用抽血血清学检测幽门螺杆菌的方法，特点是其阳性结果，被认为是有活动性的幽门螺杆菌的感染。而由于幽门螺杆菌感染后，血清中的抗体水平在半年内仍然维持阳性，血清学检测幽门螺杆菌不能区分现症感染还是过去感染，不能用于判定药物的疗效。幽门螺杆菌的碳13和碳14的尿素呼吸试验检测，目前是诊断幽门螺杆菌感染的最佳方法。碳13和碳14的检测方法也可以用于判断幽门螺杆菌药物治疗后的疗效标准。

因为幽门螺杆菌感染只能证明胃部有细菌感染，但是是胃炎、息肉或是消化性溃疡等情况，只有通过胃镜检查方式来明确。如果检查有胃炎，又有幽门螺杆菌感染，建议进行抗幽门螺杆菌治疗。如果幽门螺杆菌感染患者吹气试验结果数值较高，提示感染可能比较严重，这种病人一般建议必须做胃镜检查。如果有消化性溃疡，不论是十二指肠球部溃疡或者胃溃疡，如果有幽门螺杆菌感染，都必须抗幽门螺杆菌治疗。