扁平疣常用的外用药有干扰素凝胶、5-氟尿嘧啶的水剂或膏剂以及咪喹莫特药膏，此类药物是通过刺激局部的免疫反应，改善局部的炎症状态来清除病毒，提高免疫力。一般，治疗扁平疣，我们会根据患者皮损的不同情况来选择药物，以及治疗方法的。扁平疣如果选用外用药膏，治疗效果还是比较不错的。

彻底根治扁平疣比较困难，因为扁平疣属于病毒感染，抵抗力下降是复发的主要原因，可以从以下几个方面来进行治疗：可以去除肉眼可见的疣体，常见的是外用维A酸乳膏和重组人干扰素a-2b软膏，或者用激光、液氮冷冻的方式去除肉眼可见的疣体，但是液氮冷冻的过程会比较疼痛，因为扁平疣生长大多数比较密集，所以治疗过程会比较痛苦。1%，每天睡前点涂一次。常规使用的是调节免疫功能的药物，如转因子口服液、胸腺肽肠溶片、香菇菌多糖片等，此类药物建议口服2至3个月，有利于免疫机能的恢复正常。外用药物治疗：面部皮损可外用维A酸乳膏0。

皮疹表现为针头或者绿豆大小的扁平的丘疹，可以是肤色或者淡褐色，呈圆形、椭圆形或者不规则型，一般没有自觉症状，部分患者可以有轻微的瘙痒，但由于搔抓以后可以出现同形反应，是指搔抓的部位会出现呈串珠样排列的皮损，这一点也证明了扁平疣具有传染性。所有病毒的复制能力都是极强的，扁平疣病毒也不例外，感染扁平疣病毒后皮肤上短时间会出现大量扁平疣，也就是说扁平疣是自己传染自己厉害。扁平疣传染的，传染源是患者和健康带病毒者，主要是通过直接或间接接触传播。