角膜基质层损伤的恢复时间取决于损伤的严重程度和治疗方法。一般来说，轻度的角膜基质层损伤可以在几天到一周内自行愈合，而严重的损伤可能需要数月的时间才能恢复。

轻度的角膜基质层损伤通常可以在几天到一周内自行愈合。在这段时间内，医生通常会建议患者避免揉眼睛、用眼过度、戴隐形眼镜等可能会加重损伤的行为。同时，医生也可能会给患者开一些抗生素眼药水或涂抹一些角膜上的药膏，以预防感染和促进愈合。

对于严重的角膜基质层损伤，恢复时间可能需要数月。在这种情况下，医生通常会采用更积极的治疗方法，如手术修复、移植等。手术修复通常包括用缝合线将损伤部位缝合起来，以促进愈合。而移植则是将损伤的角膜基质层替换为健康的角膜组织。在手术后，患者通常需要在医生的指导下进行护理，如用抗生素眼药水、避免揉眼睛等，以促进愈合。

对于角膜基质层损伤的患者，应在医生的指导下进行治疗和护理，以促进愈合。