在急性期或严重的沙眼，应全身应用抗生素治疗，一般疗程三到四周，口服多西环素或红霉素等。夜间可使用红霉素，四环素类药物疗程最少十到十二周，经过一段时间治疗后，在上睑结膜仍可能存在滤泡，但这并不是治疗失败的依据。沙眼是由沙眼衣原体感染引起的一种慢性传染性结膜角膜炎症，并在睑结膜面形成粗糙不平的外观形，似沙粒样，故称为沙眼。沙眼的病原体是沙眼衣原体，沙眼治疗包括全身和眼局部药物治疗及对并发症的治疗，局部可使用0.1%的利福平滴眼剂或0.5%的新霉素滴眼剂等，一天四次。

这样的情况需要使用抗生素来治疗，外用的有氧氟沙星滴眼液，氯霉素滴眼液等等，严重的还可以口服抗生素治疗，病毒性角膜炎是由于病毒感染所导致的，这样的情况就需要使用抗病毒的药物来治疗，注意不要揉眼睛，滴眼药水之前要洗干净避免加重症状细菌性角膜炎是由于细菌感染所导致的，患者会出现眼睛疼痛，流泪，红肿等等症状。角膜炎又分为细菌性角膜炎，还有病毒性角膜炎。

病毒性角膜炎的治疗原则为抑制病毒在角膜内的复制，减轻炎症反应引起的角膜损害，不同类型的亚型治疗重点有差异，上皮型的角膜炎是由于病毒在上皮细胞内复制增殖、破坏细胞功能引起来的，因而必须给予有效的抗病毒药物，抑制病毒的活力，控制病情，而基质性的角膜炎是以机体的免疫反应为主。内皮型角膜炎的治疗方案在给予抗病毒抗炎治疗的同时，还应该积极地采取保护角膜内皮细胞功能的治疗措施，神经营养性角膜病变多出现于恢复期，治疗同神经麻痹性角膜溃疡。因此除了抗病毒外，抗炎治疗更为重要。