1、病原体

引起咽峡炎的病原体包括细菌、病毒和螺旋体等。病毒以肠道病毒、腺病毒、副流感病毒等为主，细菌以链球菌、葡萄球菌和肺炎双球菌等为主。如常见的小儿疱疹性咽峡炎主要就是由于柯萨奇A组病毒(2、4、6等亚型)感染所引起。

2、传染性

咽峡炎根据不同的病因，具有不同程度的传染性。因此咽峡炎的发生还与传播途径有关。由于病毒感染引起的咽峡炎多通过亲密接触和空气飞沫传染，比如共用餐具、打喷嚏等。因为螺旋体感染引起的咽峡炎主要通过密切接触而传染。由于细菌感染所致的咽峡炎不具有传染性。

3、条件致病

很多引起此病的细菌是条件致病菌，在人体免疫力正常时，共生于口腔，一般不会引起发病。但在不良的生活习惯如熬夜、饮食不节等导致人体营养不足时;或者情绪低落、压力过大、过度疲劳;或者所生活的环境卫生差、不注意口腔卫生等;或者身患胃肠道疾病等，都有可能降低人体抵抗力，从而引起致病菌过度繁殖，诱发本病。