男性生殖器畸形的并发症可能包括以下几种：

1. 尿道畸形：包括尿道狭窄、分叉等，会影响尿液排出和泌尿系统的正常功能。

2. 精索静脉曲张：是指精索静脉扩张、变形，可引起疼痛、不育等问题。

3. 睾丸炎或附睾炎：这是由于睾丸或附睾感染引起的炎症，可能导致睾丸肿胀、疼痛等症状。

4. 前列腺炎：前列腺是男性生殖系统中的一个重要组成部分，如果前列腺发生炎症，则可能会导致疼痛、尿频等症状。

5. 阴茎头部畸形：包括龟头炎、尖锐湿疣等，这些疾病可能会影响男性的性功能和生殖健康。

需要注意的是，男性生殖器畸形并发症的具体情况需要根据患者的具体情况进行综合评估和治疗。如果您有任何疑问或担忧，请及时咨询专业医生。