济生肾气丸和金匮肾气丸属于两种不同的中成药物，其区别在于成分不同、功效不同以及适应症不同。

1、成分不同：济生肾气丸主要由熟地黄、山茱萸、牡丹皮、山药、茯苓、泽泻、肉桂、附子、牛膝、车前子组成。而金匮肾气丸主要由地黄、山药、山茱萸、茯苓、牡丹皮、泽泻、桂枝、附子、牛膝（去头）、车前子组成。

2、功效不同：济生肾气丸具有温肾化气、利水消肿的功效。而金匮肾气丸具有具有温补肾阳、化气行水的功效。

3、适应症不同：济生肾气丸常用于治疗肾阳不足、水湿内停所致的肾虚水肿、腰膝疲重、小便不利、痰饮咳喘等症。而金匮肾气丸常用于治疗肾阳虚、肾阴虚所致的腰膝酸软、小便不利、畏寒肢冷等。