慢性结肠炎可以吃肠炎宁，肠炎宁属于抗生素类的药物，具有抗菌消炎以及健胃消食，收敛，泻热通肠，消积消胀，恢复食欲，帮助消化吸收的这样一些作用。还可以应用理中汤合四神丸，起到健脾补肾、温阳化湿的作用，口服驻车丸或乌梅丸，减轻患者的症状。在临床上如果遇到有腹部疼痛、并且有腹泻，腹胀这种患者，如果考虑有结肠炎症可以考虑应用药物肠炎宁进行治疗。

非特异性结肠炎最为常见的是溃疡性结肠炎和克罗恩病，这是由免疫因素所引起的，治疗上首选水杨酸制剂，病情严重时需要配合使用激素或免疫抑制剂，这些药物对于患者最有效。在临床上，对于结肠炎的治疗大多数情况下采用药物治疗，而且治疗效果也不错，当然有一部分结肠炎，通过正规系统的药物治疗，症状缓解不理想，或者说出现比较严重的并发症，还可以考虑手术治疗。目前治疗结肠炎比较有效和常用的药物有美沙拉嗪，美沙拉嗪这种药物副作用比较小，有口服的药物还有局部的栓剂，是比较常用的药物。

如果是急性肠炎，多是细菌感染引起的疾病，可以使用抗生素进行治疗，大多是革兰氏阴性菌感染，可以口服氟哌酸或者黄连素、磷霉素钙等药物。患有溃疡性结肠炎，如果是急性期这种情况也可以采用激素疗法控制症状，同时也可以应用免疫抑制剂或者是生物制剂治疗。治疗结肠炎的药物需要依据患者实际症状来进行选择，因为不同药物治疗症状也有所差异。