跑步的时候右边肚子疼，有以下分析：由于平时锻炼较少，跑步时肚子吸进凉气或者呼吸急促造成的，会造成胸腔负压变小，阻碍肝脏血液回流，引起肝脏淤血疼痛或者因为剧烈运动导致的肠道胀气，患者在跑步前一定要做好热身，出现疼痛的症状后，要停止锻炼，避免疼痛加重。右侧腰部有可能有输尿管结石的可能，比如说常见的右肾和输尿管病变会导致右边肚子疼痛，还有就是右下腹疼痛要考虑有阑尾炎。跑步时右下腹痛，有可能是肠道痉挛产生的，一般都在休息以后，也可以是多做几次深呼吸以后疼痛可以缓解。

炎症还有可能会刺激肠道黏膜，使得肠道的消化能力下降，并且存在脓性的分泌物，而容易引起腹泻症状，建议及时使用消炎药，解痉止痛药和止泻等对症的药物进行治疗。拉肚子，肚子疼痛，在临床上比较常见的为急性胃肠炎所导致的，也不能排除和肠道功能紊乱有关系。拉肚子，肚子疼的原因很多，最常见的是感染的因素，包括病毒感染、细菌感染和寄生虫的感染。

建议到正规医院就诊，必要时完善大便常规、血常规、大便培养甚至结肠镜等相关检查，以明确病因，明确病因后针对性的进行抗感染、抗病毒、解痉止痛、调节肠道菌群、纠正水电解质紊乱等对症治疗。有肚子疼痛拉水的现象，一般是由于肠炎导致的。调节肠道菌群失调的药物，如乳酸菌素片等治疗效果比较好。