临床上对于肛瘘的治疗，一般建议采取手术治疗清除干净内口以及瘘管，才能根治肛瘘。如果单纯的外口症状改善，但内口以及瘘管没有清除干净，反而瘘管会越来越多，形成复杂性肛瘘。在临床上肛瘘外涂药膏主要是针对外口出现的感染发炎、红肿，使用消炎的药膏。比如可以选择百多邦软膏、红霉素软膏或者是麝香痔疮膏等药物，可以缓解局部不适。

肛瘘术后拉肚子，意味着大便的次数增多。大便次数增多就有可能使大便反复刺激到肛瘘术后伤口，粪便反复刺激伤口就有可能导致伤口感染，伤口感染就有可能导致伤口愈合延迟。有些感染严重且处理不及时的伤口，还有可能会需要做第二次手术，反复的炎症刺激就有可能导致伤口水肿。水肿如果还是反复刺激就有可能消退不掉就形成息肉，伤口处的息肉通常是需要手术来切除处理。另外对于肛瘘术后需要注意饮食，避免出现拉肚子症状。

对于伤口手术后，因为伤口没有完全愈合，有个创腔，所以肛门的闭合功能就不完全，对于大便质地比较稀的，会有可能出现粪水流出，这属于正常情况，伤口慢慢愈合，肛门闭合功能完善了，有可能就不会出现漏粪的症状；对于肛瘘患者手术完全愈合了，还有出现漏粪水这种情况，此时就要考虑是否有肛门失禁的情况，对于轻度的肛门失禁，有可能会出现一些渗液，对于比较严重的肛门失禁的情况，而伤口完全愈合，有可能会出现漏粪的症状，这个时候要进一步行直肠测压，明确肛门功能，必要的时候还需要进一步治疗。肛瘘手术后没有完全愈合，出现漏粪的情况，属于正常情况，但是要区别手术没有完全愈合，出现漏粪的情况，和手术后伤口完全愈合，出现漏粪这种情况。