克罗恩病，本病的临床表现x线及内镜所见常和肠结核酷似，必须仔细鉴别。二，右侧结肠癌，本病比肠结核发病年龄大常在四十岁以上，一般无发热、盗汗等结核毒血症表现，结肠镜检查及活检可以确定结肠癌的诊断。三，阿米巴病或血吸虫病性肉芽肿，既往相应的感染史，浓血便常见，粪便常规或孵化检查发现有关病原体结肠镜检查，多有助于鉴别诊断，相应的特效治疗有效。四，其他肠结核，有时还应当与肠恶性淋巴瘤及一些少见的感染性肠病如非典型分枝杆菌，性病性淋巴肉芽肿，梅毒侵犯肠道等，以发热为主要表现者，需要与伤寒的长期发热性疾病相鉴别。

也可能并发结核毒血症，导致发热、盗汗、乏力、消瘦等，也可以并发腹部包块的形成，或者导致腹胀便血，并发肠梗阻等的情况。肠结核会出现的并发症，主要是会导致腹痛，以及大便性状的改变，往往会并发腹泻的症状，还可能出现腹泻与便秘交替出现的症状。一旦诊断成立，一定要积极的进行正规有效的抗结核药物治疗，还要加强营养支持治疗。肠结核是由于结核分枝杆菌侵犯到肠道，所引起的一种慢性特异性感染，也是比较常见的结核病之一。

肠结核的晚期症状，一般会表现为不同热型的长期发热，会由于疾病的进展和活动而出现营养素缺乏的情况。治疗方面要进行有效的抗结核药物联合治疗，在出现肠结核并发症，肠梗阻以及肠穿孔的时候，需要采取手术治疗的方法。出现这些情况，往往预示着肠结核为进展期和晚期在。会导致出现消瘦贫血，还会并发肠外的结核，尤其是活动性的肺结核。