治疗角膜炎没有最好的眼药水，只有针对它特定病因的角膜炎进行治疗的最好的眼药水。从病因我们可以分成三类，第一感染源性的，通常我们可以对症进行治疗，比如细菌性角膜炎，我们可以抗细菌治疗。病毒性角膜炎可以抗病毒治疗。第二是内源性的角膜炎，由于免疫性的因素而引起的一些角膜炎，我们可以进行免疫抑制剂的治疗。第三是局部蔓延性的，由于巩膜、虹膜等的炎症而引起的角膜的炎症，因此我们可以通过对症来进行治疗。

角膜防御能力的减弱，外界或内源性致病因素均可能引起角膜组织的炎症反应，统称为角膜炎。其原因有感染源性，内源性如自身免疫性全身疾病或维生素A缺乏等，以及局部蔓延：邻近组织的炎症，可波及角膜，引起角膜炎。角膜炎的病因虽然不一，但其病理变化过程通常具有共同的特性，可以分为浸润期、溃疡形成期、溃疡消退期和愈合期四个阶段。不同原因导致的角膜炎其愈合时间及预后各不相同，部分病例数周后可以痊愈，部分病例若病因未消除，则迁延不愈或反复发作。

控制感染针对致病微生物，适当地选用抗生素，配制成不同浓度的眼药水或者是眼药膏进行点眼，对于严重感染的病例，可以首先选用广谱抗生素，比如庆大霉素、卡那霉素、氯霉素等眼药水滴眼，必要时可以做结膜下注射及全身用药，可一药单用或者联合用药。散瞳，凡有虹膜刺激症状，如瞳孔缩小、对光反应迟钝，并且虹膜睫状体发炎，均应该进行散瞳处理，散瞳的药为阿托品及眼膏，必要时可以结膜下注射散瞳剂。皮质类固醇的应用只限于变态反应性角膜炎，或者是角膜溃疡愈合后，角膜基质浸润及水肿时应用，对于各种原因引起的角膜上皮损伤或者是角膜溃疡，原则上禁用皮质类固醇，以免促使溃疡恶化或者延缓上皮损伤的愈合。