3岁宝宝耳朵痛可能是耵聍栓塞、外伤、中耳炎、外耳道炎引起的。

1、耵聍栓塞：3岁宝宝耳道内耵聍分泌过多形成耵聍栓塞，会出现耳道瘙痒、耳内有闷胀感，出现继发性感染时还会导致耳朵痛、头痛，建议到耳鼻喉科就诊，在医生的指导下滴入碳酸氢钠溶液等软化耵聍的药物，等耵聍变软后将其取出。如果伴有感染，应该先服用头孢克肟等消炎药物控制感染。

2、外伤：3岁宝宝不小心摔倒碰撞到耳朵或者被尖锐的物体划伤，也有可能会使耳朵痛，可能还会伴有红肿。轻度的损伤，可以使用碘伏进行消毒，并局部涂抹莫匹罗星软膏等外用药。如果损伤比较严重，建议就医在医生指导下进行处理。

3、中耳炎：中耳炎指的是中耳部位发生炎症感染，会导致3岁宝宝耳朵痛、耳闷，建议服用阿莫西林、头孢呋辛等药物进行治疗。如果感染较重，必要时需要通过手术治疗。

4、外耳道炎：外耳道炎可能是由于真菌性感染、细菌性感染所致。发病后外耳道的皮肤和组织会受到炎症的刺激，从而导致3岁宝宝耳朵痛，可以使用氧氟沙星滴耳液进行治疗。