任何手术术后都可能存在一定的后遗症，肛瘘手术也不例外。肛瘘手术常见的后遗症主要如下：1、肛门溢液即流粪水；2、肛周湿疹即肛周的皮肤起小疙瘩伴有瘙痒；3、大便失禁或者不完全失禁，大便失禁是成形的粪便夹不住，不完全失禁是对于气体或者液体夹不住，走路或者运动的时候不自觉的会溢出一些东西；4、极少数切口会有瘢痕，有一种麻、压痛的感觉，但是发生的机会往往都很少，往往是由于换药不及时或者术后没有注意休息，疏于局部的清洁、透气造成的。所以肛瘘手术以后一定要配合医生治疗，及时清洗创面、伤口，不能自己在家里随便擦点药，觉得擦干净了就可以了，因为刀口很容易假愈合、粘连，所以一定要找正规的医生进行换药。

肛瘘的中医治疗方法是根据肛瘘类型辨证施治的。肛瘘按中医辨证可分为三型。第一湿热下注型。舌红，苔黄腻，脉滑数，方用革薛渗湿汤加减，有清热利湿，消炎止痛的作用。第二个正虚邪恋型。舌淡，苔薄，脉濡，方用托里消毒饮加减，有扶正祛邪的作用。第三阴液亏虚型。舌红少津，少苔或无苔，脉细数无力，方用青蒿鳖甲汤加减。有养阴托毒的作用。但是肛瘘在临床上都需要手术治疗才能治愈。如果在术后按照中医辨证分型辨证施治，能达到事半功倍的效果。

若患者出现持续性肛门坠胀，则需考虑复发的可能性，应及时就医确诊，在医生指导下再次进行治疗。若肛瘘复发后需再次进行手术治疗，因此应注意预防肛瘘复发。肛瘘手术后复发的前兆主要包括，肛门坠胀，患者不适感逐渐加重；首先在术前需充分检查，确定瘘管走行和内口位置，制定合理手术方案；