按摩肩膀时发出咯吱咯吱声音，可能是由于生理或病理原因引起的，例如筋膜炎或颈椎病等。这些问题可以通过物理治疗和药物治疗来改善。以下是具体分析：

一、生理原因

如果长时间保持同一动作，肌肉可能会变得僵硬和痉挛，导致上述反应。通常通过按摩和适当的活动可以逐渐缓解这种状况。

二、病理原因

1、筋膜炎

筋膜炎是筋膜的无菌性炎症，可能受劳损、潮湿、免疫因素等影响。如果患有这种疾病，可能会出现上述症状。医生可能会建议使用吲哚美辛肠溶片、双氯芬酸钠缓释片等药物进行治疗。

2、颈椎病

颈椎病可能是由于长期劳损和骨质增生等因素导致的。这种疾病可能会引起关节软骨的摩擦，从而导致上述不适。在医生的指导下，可以选择甲钴胺片、布洛芬缓释胶囊等药物来缓解症状。

除了上述原因，肩周炎、风湿性关节炎、滑膜炎等也可能与这种情况有关。如果没有改善，应及时前往正规医院就诊。