胚胎移植第六天小肚子胀是一个常见现象，可能由受精卵着床、激素水平波动以及消化不良等因素引起。具体分析如下：

1. 受精卵着床

在胚胎移植第六天，受精卵开始逐渐着床并稳定下来，这个过程中可能会伴随一些不适症状，如腹胀等。不过，这是身体正常的生理反应，无需过度担心，通常会在一段时间后自行缓解。

2. 激素水平波动

进行胚胎移植后，体内的雌激素和孕激素水平会发生变化，这可能会导致一些不适，如恶心呕吐和胚胎移植第六天小肚子胀。为了了解胎儿的发育情况，建议定期前往医院进行B超检查。

3. 消化不良

过量食用难以消化的食物可能会导致食物在肠道内堆积而难以消化，从而引起胀气等现象。在医生的指导下，可以使用健胃消食片、乳酸菌素片等药物来缓解消化不良的症状。

除了上述原因外，子宫内膜受损、异位妊娠以及胚胎死亡等情况也可能导致类似的症状。若症状持续存在，建议及时就医，以便得到相应的治疗，从而改善病情。