脖子和喉咙两侧的疼痛受到多种因素的影响，可能与上呼吸道感染、淋巴结炎、扁桃体炎等有关。在出现这些症状时，及时就医检查是必要的，以确定病因，并选择相应的治疗药物。以下是具体分析：

1、上呼吸道感染

当自身抵抗力低下，遭受病毒或细菌感染后，可能引起上呼吸道感染，导致呼吸道黏膜水肿和炎性物质渗出，从而出现咳嗽、咽痛等症状。针对个体状况，医生可能会建议使用利巴韦林颗粒、蒲地蓝口服液、阿奇霉素颗粒等药物，并在治疗期间注意口腔卫生。

2、淋巴结炎

当病原体侵犯淋巴结时，可能引起炎症反应，刺激周围组织，导致颈部和咽喉出现疼痛。建议患者遵循医嘱，使用注射用青霉素钠、注射用更昔洛韦、罗红霉素胶囊等药物治疗，以尽早减轻不适症状。

3、扁桃体炎

由于病原体损害扁桃体上皮细胞，可能导致扁桃体黏膜充血和肿胀，出现咽痛、咽干等症状，严重时可能放射到颈部。患者需根据医嘱使用复方硼砂含漱液、阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物治疗，并在用药期间注意休息。

除了上述原因外，脖子和喉咙两侧的疼痛还可能与甲状腺炎、甲状腺结节、甲状腺功能亢进症等有关。建议在出现上述症状后及时就医治疗，并在治疗期间注意控制日常饮食，避免摄入辛辣和刺激性食物，以免造成不良刺激。