39℃的发热通常是由流行性感冒、急性扁桃体炎或肺炎等引起的。这些情况的具体分析如下：

1. 流行性感冒:

流感病毒感染引起的一种常见病毒感染疾病，患者可能会出现发热、全身疼痛等症状。治疗方面，患者应根据医生的指导使用口服磷酸奥司他韦胶囊或吸入扎那米韦粉雾剂等药物。

2. 急性扁桃体炎:

由于气候变化或致病菌感染引起的急性感染性炎症，导致患者腭扁桃体肿大、疼痛，严重时可能出现高热和抽搐。患者应在医生的指导下使用吲哚美辛胶囊、布洛芬片等药物进行退热。

3. 肺炎:

细菌或病毒感染导致肺泡和肺组织炎症，引发发热、恶心、胸痛等症状。患者应遵循医生的建议，使用左氧氟沙星片、阿司匹林维生素C泡腾片等药物进行治疗。

除了上述原因，还有其他可能引起发热的因素，如败血症、急性乳腺炎、胆管癌等。患者应及时就医进行检查，并根据检查结果接受针对性的治疗，以避免对身体造成更严重的损伤。