甲状腺功能3项和5项检查的区别体现在检查内容、临床意义和临床应用等方面。

首先，在检查内容方面，甲状腺功能3项主要包括促甲状腺激素、游离T3和游离T4的检测；而甲状腺功能5项则包括游离T3、游离T4、总T3、总T4以及调节甲状腺激素合成分泌的促甲状腺激素。

其次，在临床意义上有所不同。通过甲状腺功能3项检查，可以初步判断患者是否存在甲亢或甲减的病情；而甲状腺功能5项检查则包含了甲状腺功能3项的内容，并能提供更全面的信息。

最后，在临床应用方面也存在差异。对于普通甲亢患者，在复查过程中通常可以通过甲状腺功能3项检查来反映甲状腺激素水平的代谢情况；然而，对于伴有甲状腺功能亢进症的弥漫性甲状腺肿患者或桥本氏甲状腺炎患者，则需要进行甲状腺功能5项检查以评估抗体水平。

综上所述，甲状腺功能3项和5项的区别主要体现在检查内容、临床意义和临床应用等方面。了解这些差异有助于医生更全面地评估患者的甲状腺功能，并制定相应的治疗方案。