重复尿道临床表现不尽一致，与其类型有关。最常见的症状是尿道感染，副尿道尿流不畅，所以副尿道常有感染。由于病灶隐蔽，常是慢性尿路感染的一个病灶。

第Ⅰ型及内口与正尿道相通、同时有外口的第Ⅱ型重复尿道，排尿时尿由两个尿道口排出，为双股，副尿道尿线较细，有的仅滴沥尿数滴。副尿道既可排尿，亦可排精，有的只排精不排尿。第Ⅲ型重复尿道排尿时，会阴部漏尿或直肠排尿。若副尿道近端为盲端，不与尿道相通时，则只能看到副尿道外口，既不排尿也不排精。若副尿道远端为盲端，感染后分泌物集聚，则副尿道扩张呈囊状，形如尿道憩室。副尿道开口于阴茎背部时，尿道口的远端呈索状，与尿道上裂相同，阴茎勃起时向背侧弯曲，影响性生活。

第Ⅰ型重复尿道的副尿道平滑肌发育不全，约半数病人有尿失禁。轻者发生压力性尿失禁，重者为完全性尿失禁。第Ⅱ型若副尿道发生炎症，尿道分叉处的黏膜水肿，或副尿道内分泌物积聚，可压迫正尿道发生排尿困难，产生尿道梗阻的症状。

重复尿道因其不同类型，临床表现各异，其诊断除临床症状、体征外，需依据尿道逆行造影及排泄性膀胱尿道造影做出诊断，并可了解副尿道与正尿道以及膀胱之间的关系。