通常情况下，过氧苯甲酰凝胶和甲硝唑凝胶在主要成分、适应症和药品类型等方面存在差异。以下是具体内容：

1. 主要成分的不同:

过氧苯甲酰凝胶的主要成分是过氧苯甲酰，而甲硝唑凝胶的主要成分是甲硝唑。

2. 适应症的不同:

过氧苯甲酰凝胶通常用于治疗寻常痤疮，而甲硝唑凝胶通常用于治疗炎症性丘疹、脓疱疮和酒渣鼻红斑。

3. 药品类型的不同:

过氧苯甲酰凝胶属于消毒防腐药，而甲硝唑凝胶属于抗厌氧菌药和抗滴虫药。

此外，不良反应和注意事项也存在差异。过氧苯甲酰凝胶和甲硝唑凝胶是两种不同的药物，建议患者按照医嘱使用它们，不要混用。