跑步时出现膝盖疼痛可能是由生理或病理因素引起的，其中常见的原因包括腰椎间盘突出和半月板损伤。根据不同的原因，可以选择适当的治疗方法。

一、生理因素

如果晚上睡觉时不盖被子，可能导致局部感冒，并在单膝内侧积聚大量乳酸，但通常情况下并不严重。一般无需特殊处理，可以通过热敷促进局部血液循环，从而改善局部肿胀。

二、病理因素

1. 腰椎间盘突出症

腰椎间盘突出症会导致腰部组织压迫局部神经，常引起单侧下肢瘫痪。如果在长时间疲劳后未能合理休息，也可能引发关节疼痛。此时应前往正规医院进行相关检查，并在医生的指导下选择按摩、推拿等物理疗法。

2. 半月板损伤

半月板损伤通常由于纤维关节软骨损伤引起，可能是长期疲劳活动或局部摩擦造成的。长时间的疲劳活动容易导致局部疼痛。需要合理休息，可在医生指导下选择保守治疗方法，例如加压包扎固定2-3周。如果情况比较严重，则可能需要手术干预。

另外，跑步时膝关节疼痛也可能是骨关节病变引起的。建议及早就医检查，以免病情加重。