跑步后屁股两侧酸痛一般属于正常现象，但具体情况需要根据患者的实际情况来分析。

1、正常现象

对于平时长期不运动或者运动较少的患者，在突然进行较大运动力度的跑步时，可能导致臀部肌肉出现过度收缩。这样会导致大量乳酸在局部堆积，乳酸的积累会刺激局部肌肉，出现肌肉疼痛症状。可以通过热敷或按摩的方式来改善状况，这能够加速乳酸的代谢吸收，缓解局部疼痛。

2、非正常现象

如果跑步后屁股两侧的酸痛持续时间较长，可能是由病理性因素导致，比如腰椎间盘突出、骶髂关节炎等问题。这些疾病在跑步后可能会导致屁股两侧出现酸痛的症状。如果疼痛情况严重，建议在医生指导下使用布洛芬缓释片、甲钴胺片等药物进行治疗。

除了以上情况，症状严重时应及时前往医院进行CT或核磁共振检查，以明确诊断。在治疗期间应注意多休息，避免进行剧烈运动。