吞咽口水时喉咙痛和左后脑痛可能是由生理或病理因素引起的，例如扁桃体炎和咽喉炎等。针对不同情况需要进行相应的治疗。

一、生理因素

长期承受精神压力过大、焦虑、紧张、疲劳和劳累可能会刺激周围神经，导致后脑勺疼痛。一般来说，不需要特殊治疗，但应注意休息，避免过度劳累，可以自行缓解症状。

二、病理因素

1. 扁桃体炎

扁桃体炎通常由感染引起，主要表现为咽痛，常伴有头痛、咽喉干燥等症状，有时吞咽唾液后会出现后脑勺疼痛。治疗可根据医生建议使用阿莫西林胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片等药物。如果周围组织出现水肿，可以在医生指导下使用地塞米松片消肿。如果口服药物没有明显改善，可以考虑静脉注射青霉素、头孢类抗生素，并结合雾化吸入治疗。

2. 咽喉炎

咽喉炎是由病毒或细菌感染引起的，出现咽喉部灼热、发痒、肿痛等症状，严重时会伴有头痛、发热等全身症状，吞咽唾液后可能会出现后脑勺疼痛。治疗可在医生指导下使用青霉素片、阿莫西林胶囊、利巴韦林片等药物。

另外，吞咽口水喉咙痛和左后脑痛也可能是颈椎病引起的。建议患者如有身体不适应及时就医。