通常情况下，头孢曲松钠和头孢噻肟钠都属于第三代头孢菌素类抗生素，它们在结构、功效和药代动力学等方面存在一些差异。以下是具体的分析：

1、结构

头孢曲松钠和头孢噻肟钠在化学结构上相似，但头孢噻肟钠含有N-甲基硫四氮唑侧链，而头孢曲松钠含有N-甲硫三嗪环。

2、功效

头孢噻肟钠适用于由敏感细菌引起的肺炎和其他下呼吸道感染、尿路感染、脑膜炎、败血症、腹腔感染、盆腔感染、皮肤软组织感染、生殖道感染、骨骼和关节感染等情况；此外，它也可以用作小儿脑膜炎的药物选择。头孢曲松钠适用于由敏感致病菌引起的下呼吸道感染、尿路感染、胆道感染，以及腹腔感染、盆腔感染、皮肤软组织感染、骨骼和关节感染、败血症、脑膜炎等，还可用于手术期感染预防，单剂量可治疗单纯性淋病。

3、药代动力学

头孢噻肟钠的半衰期约为1小时左右，蛋白结合率较头孢曲松钠低，大部分通过肾脏排泄，仅有少量通过胆汁排泄。头孢曲松钠的半衰期约为8小时左右，蛋白结合率较头孢噻肟钠高，主要通过肾脏和胆汁排泄。

除了上述常见区别，头孢曲松钠的抗菌谱稍微广泛一些，相较头孢噻肟钠，它对更多种类的细菌有作用。因此，在使用这些药物时，应该遵循医嘱，选择合适的药物。同时，务必注意遵循医生的指导，避免滥用和误用，以免导致不良反应和耐药性问题。