一般情况下，眨眼时头皮感到不舒服可能是由于软组织损伤、神经性头痛、带状疱疹等原因引起的。这种不适可以通过物理疗法和药物治疗来改善。以下是具体分析：

1. 软组织损伤

当头部受伤时，局部软组织可能会发生炎症性渗出，导致肿胀、疼痛等症状。当眨眼时，这个区域会受到牵拉，从而引起头皮的不适感。医生可能会建议局部涂抹消肿止痛酊、云南白药气雾剂等药物来治疗。

2. 神经性头痛

神经性头痛的发病原因尚不清楚，可能与过度吸烟、长时间饮用咖啡、浓茶等有关。患者通常会出现太阳穴、眼眶等部位的疼痛，同时伴有头部刺痛感和压迫感。医生可能会建议服用布洛芬缓释胶囊、维生素B12片等药物治疗。

3. 带状疱疹

如果身体感染了带状疱疹病毒，病毒会在神经支配区域大量繁殖，并引发炎症反应。症状主要包括水疱、神经支配区域疼痛、痛感和抽搐等。医生可能会建议服用阿昔洛韦片、更昔洛韦胶囊等抗病毒药物治疗。

除了上述常见原因外，其他可能导致头皮不适的原因还包括干眼症、青光眼和带状孢疹等。为了确定病因，建议进行全面检查，并遵循医生的正确治疗方案。