耳朵根后面疼痛可能有多种原因，以下是一些常见的原因：

1. 过敏性鼻炎：过敏性鼻炎是一种常见的疾病，通常会导致耳朵和鼻子周围的皮肤发红、肿胀、瘙痒等症状。在这种情况下，耳朵根后面的疼痛可能是过敏性鼻炎引起的。

2. 外伤：耳朵根后面也可能受到外伤，如打击、碰撞等。这些伤害可能会导致耳朵周围的皮肤破裂或出血，从而引起疼痛。

3. 感染：某些疾病也可能导致耳朵根后面的疼痛，如细菌感染、淋巴结炎等。这些感染通常会引起发热、头痛、恶心等症状。

4. 药物副作用：某些药物也可能导致耳朵根后面的疼痛，如抗抑郁药物、镇静剂等。

如果您的耳朵根后面疼痛持续时间较长或伴随其他症状（如发热、头痛等），建议您及时就医，以便进行进一步检查和治疗。