肩胛骨肌肉酸痛的原因有两种，一种是生理性因素，另一种是病理性因素。建议前往医院进行检查，明确具体的病因。具体情况如下：

一、生理性因素：

肩胛骨肌肉酸痛可能是由长期姿势不良或保持一种姿势等原因导致的。长期处于紧张状态的肩胛骨肌肉可能会引起痉挛，从而导致肩胛骨疼痛的症状。通常，这种情况无需特殊治疗。建议多休息，适当进行运动，并养成良好的坐姿和站姿。这样的措施会逐渐缓解症状。

二、病理性因素：

1. 肩周炎：

肩周炎可能是由长期过度活动、姿势不良导致的慢性劳损，或者肩关节软组织退变、承受能力减退等原因引起的。这会导致肩关节囊及周围韧带、肌腱和滑囊受损，从而形成肩周炎，进而导致肩胛骨部位的肌肉酸痛现象。建议在专业医生的指导下进行针灸、按摩等治疗，以缓解疼痛。

2. 颈椎病：

颈椎间盘退行性病变可能导致椎间隙狭窄，颈椎稳定性下降，形成颈椎病。当退变组织压迫和刺激相邻的脊髓、神经、血管等结构时，也会引起肩胛骨出现酸痛的现象。建议在医生的指导下服用塞来昔布胶囊、美洛昔康片、洛索洛芬钠片等药物治疗，以减轻炎症、缓解疼痛。

除此之外，患有风湿性关节炎也可能导致类似的症状。在医生的指导下进行治疗，可以避免疾病进一步加重。