在肛肠疾病中，肛瘘手术后的复发率是比较高的，这主要是指高位复杂性肛瘘。所以高位肛瘘的治疗目前仍是国内外公认的难题。肛瘘手术后，肛瘘容易复发主要原因有以下几点：

1、内口处理不当：绝大多数是因为内口没有找准确，或没有把感染的原发灶即内口彻底清除。

2、肛门腺处理不当：据近年来的研究表明，肛门腺感染是肛瘘的重要病因，因此，要切除干净内口，以及内口附近有炎症的肛门腺及肛门腺导管。

3、瘘支管及其瘘空腔清除不彻底：即在手术中没有刮干净坏死组织或清除支管，即可导致复发。

4、内口复杂：即瘘内口二个或二个以上时，寻找内口不完全，导致复发。

5、新生成的肛瘘：这种情况多是因为患者又发生了肛周脓肿的症状，从而导致了新的肛瘘的发生，给人们一种肛瘘又复发的错觉。

如果是高位复杂性肛瘘，手术后大约有1/5的人可能复发;如果是高位单纯性肛瘘，手术后大部分都能瘘愈，极个别人复发;如果是低位复杂性肛瘘，手术后应该都能治愈，复发者可能是有未被发现的高位瘘。单纯的低位肛门瘘，手术后都能治愈，不会复发。

由此可见，治疗肛瘘不仅要到专业的肛肠专科医院进行治疗，还要注意日常生活的护理，防治肛瘘复发率。