睡觉时出现咳嗽导致醒来可能是由生理或病理因素引起的。

生理因素可能是由于睡眠环境干燥，导致咽喉或鼻腔缺乏水分，使得口部呼吸增加。

病理因素可能有以下两种情况：

1. 过敏性咳嗽：可能是因为在睡觉过程中暴露于容易引起过敏反应的物质，如尘螨、棉絮等，刺激呼吸道引发过敏性咳嗽。

2. 胃食管反流：患者可能存在胃食管反流问题，当平躺睡觉时，胃酸和食物倒流到咽喉部，刺激咽喉组织引发咳嗽。

此外，心脏功能不全等原因也可能导致这种情况。建议在明确病因后进行规范治疗。