新生儿六个脚趾的原因可能有多种，以下是一些常见的原因：

1. 基底骨裂：这是一种罕见的骨骼畸形，通常发生在出生后几周或几个月内。基底骨裂可能会导致新生儿的脚趾弯曲，并且在长大后会变得不平整。

2. 肌肉拉伤：如果宝宝在出生时受到了过度用力或拉伸的刺激，就有可能导致脚趾肌肉拉伤。这种情况通常会自行恢复，但需要注意保持宝宝的足部干燥和清洁。

3. 感染：如果宝宝患有感染性疾病，例如皮肤炎症或细菌感染，也可能导致脚趾的畸形。这种情况下，医生可能会开具抗生素治疗。

4. 遗传因素：有些人天生就有六个脚趾，这种情况被称为“多指”。

5. 先天性缺陷：一些先天性缺陷可能导致新生儿六个脚趾，例如脊柱裂、髋关节发育不良等。

总之，如果您的宝宝出现任何与脚部相关的问题，建议及时咨询医生进行诊断和治疗。