内镜检查是一种具有侵入性的过程，会给患者带来一定的痛苦，而且一些患者可能无法忍受，尤其是年龄较大的患者容易引发心血管疾病。此外，内镜检查还存在一定的风险，有时也可能因为患者无法忍受而中止肠镜检查。

由于结直肠在检查过程中可能会出现皱缩，因此内窥镜所观察到的肿块距离肛缘的远近可能存在误差。然而，现在已经有了无痛肠镜检查，患者在睡眠状态下无需承受任何痛苦，就可以完成检查。肠镜检查的最大好处在于能够直观、准确地发现病变，特别是通过组织取样进行病理学检查，以明确诊断。

影像学检查的主要优点是能够准确确定病变的位置，患者的痛苦和风险较小，检查时间也较短。然而，它的缺点是无法直接诊断，也不能确定病变的性质。