巧克力囊肿手术后月经不来是否属于正常现象，取决于术后身体状况。具体情况如下：

1. 正常情况：

通常，在巧克力囊肿手术后月经会暂时推迟。对于卵巢储备功能较好的患者，通常在手术后一个月左右就会来月经。对于卵巢储备功能较差，卵泡恢复较慢的患者，可能需要2~3个月才会恢复月经。建议患者暂时观察，同时在日常饮食上增加营养，养成良好的生活和饮食习惯。

2. 不正常情况：

如果在巧克力囊肿手术后三个月仍未恢复月经，则属于不正常现象。这可能是由于术后暴饮暴食、经常食用辛辣刺激性食物，或患有宫颈柱状上皮异位等原因所致。

若术后出现身体不适，建议及时就医，在医生的指导下进行详细检查，并积极接受治疗。正确的诊断和治疗将有助于恢复月经周期和身体健康。