肚脐眼有红疙瘩可能是由生理因素或病理因素引起的。其中病理因素可能包括毛囊炎、脐周湿疹等，因此需要根据具体情况进行相应处理。以下是对各因素的具体分析：

一、生理因素

肚脐眼是皮肤凹陷部位，通气性较差。如果个人卫生不够注意，肚脐眼内部可能会积聚大量污垢，从而滋生细菌，引发炎症反应。这些炎症因子可能刺激周围的皮肤，导致肚脐眼出现红疙瘩。建议定期保持肚脐眼的清洁，以确保其卫生状况。

二、病理因素

1、毛囊炎

若长期存在不良生活习惯，例如经常搔抓肚脐眼区域，可能使手指表面携带的细菌进入体内，导致炎症反应，形成毛囊炎，从而出现红疙瘩症状。通常毛囊炎无明显异常表现，部分患者可能会出现轻微疼痛。对此，可使用酒精、碘伏消毒液等清洁肚脐眼，一般能够自行恢复。

2、脐周湿疹

如果患者常穿金属纽扣的裤子，金属与脐周皮肤直接接触，金属表面的化学物质可能会强烈刺激该部位，引起脐周湿疹，导致上述症状。建议患者遵医嘱使用氯雷他定片、盐酸左西替利嗪片等药物进行治疗。

此外，红疙瘩的原因还可能包括脐炎、带状疱疹、疥疮等。肚脐眼区域的皮肤较为敏感，建议在恢复期间避免过度刺激，以免造成局部疼痛。如果情况严重或持续，请及时就医寻求专业建议。