咽口水引起耳朵疼痛，主要有两个原因。首先，可能是由于咽喉部发生了炎症，例如急性咽喉炎。在这种情况下，吞咽口水时会感到喉咙疼痛，而喉咙疼痛容易产生反射性疼痛，可能会向耳部放射，导致耳朵疼痛。

第二个原因可能是由于耳朵本身存在外耳道炎或中耳炎。在咽口水的同时，头面部肌肉的运动可能会引起已经存在的中耳炎或外耳道炎导致的耳朵疼痛。

总结来说，主要有两个方面的原因导致咽口水时耳朵疼痛：一是咽喉部发生炎症，疼痛放射到耳部；二是耳朵本身存在炎症，咽喉动作加剧了耳部的疼痛感觉。