长时间站立导致臀部两侧疼痛可能是由于生理或病理因素引起的。其中，可能的病理原因包括肌筋膜炎和腰椎间盘突出症等。根据不同的原因，可以选择适当的处理方法。具体分析如下：

一、生理因素

如果是由于站立时间过长导致臀部肌肉长时间处于紧张和收缩状态，引起局部代谢产物堆积，从而导致劳损或痉挛性疼痛，一般来说，这是正常现象。适当休息可以逐渐缓解疼痛。

二、病理因素

1. 肌筋膜炎

如果臀部发生肌筋膜炎，并且长时间站立，可能会导致局部软组织劳损和无菌性炎症。可以遵循医生建议使用双氯芬酸钠缓释片、对乙酰氨基酚缓释片、布洛芬缓释胶囊等消炎止痛药。同时，可以结合红外线、超短波等物理治疗方法。必要时，根据医生建议选择小针刀或射频消融术等治疗方法，以切除病变组织并减轻疼痛。

2. 腰椎间盘突出症

如果是腰椎间盘突出症导致的疼痛，患者长时间站立会使腰椎间盘突出的组织对下肢神经造成压迫。在医生的指导下，可以使用肌肉松弛药物，如盐酸替扎尼定片、乙哌立松片、氯唑沙宗片等进行改善。如果神经根压迫比较明显，药物治疗效果不佳，可以结合医生选择椎间孔镜髓核摘除术、椎板切除病灶清除减压术等手术治疗方法。

此外，疼痛也可能是由于骨折、股骨头坏死、骶骨关节炎等疾病引起的。建议及时就诊，并按医生的建议进行治疗。