治疗手指关节肿痛的首要步骤是明确引起疼痛的原因。一般而言，原因可以大致分为两类。第一类是由于骨性关节炎、风湿性关节炎或类风湿关节炎等导致的手指关节的无菌性炎症。无菌性炎症会产生致疼性的因子，进而导致手指关节肿胀和疼痛等症状。

对于这种病因，一般采用对症治疗，口服非甾体类消炎药物是常见的选择。按照说明书上的用法和用量坚持服用一周，通常可以明显减轻手指关节的肿痛。

另一大类引起手指关节肿痛的原因是细菌感染，导致化脓性手指关节炎。对于这种疾病，治疗可以采用静脉输注抗生素或口服抗生素的方式。