原核细胞和真核细胞在结构和功能上存在相似之处，如细胞膜、细胞质和核糖体。然而，它们之间存在显著差异。

1. **组织结构差异：**

- **体积和细胞壁：** 原核细胞较大，其细胞壁主要由肽聚糖构成，而真核细胞的细胞壁主要包含纤维素和果胶。

- **细胞器：** 原核细胞只含有核糖体，而真核细胞则拥有多种细胞器，如细胞核、内质网、溶酶体和高尔基体等。

- **DNA结构：** 原核细胞的DNA裸露，没有染色体和染色质，而真核细胞拥有染色体和染色质。

2. **遗传和生殖方式差异：**

- **遗传规律：** 原核细胞的遗传不符合孟德尔规律，而真核细胞主要遵循孟德尔遗传规律。

- **生殖方式：** 原核细胞通过无性生殖，依靠分裂进行繁殖，而真核细胞则进行有性生殖，具备有丝分裂和减数分裂两种方式。

3. **生态系统角度：**

- **生态角色：** 原核细胞可以进行光合作用，属于生产者，而真核细胞主要属于消费者，参与分解过程。

总体而言，原核细胞和真核细胞在结构、功能和生态系统中的角色存在显著差异，这些差异反映了它们在生物界中独特的生物学特征。