肛裂通常发生在肛门瓣和肛门缘之间，内括约肌最下部浅面。初起只是肛管皮肤裂口，有的裂到皮下组织或括约肌。裂口呈线形或梭形，将肛管扩张，则呈圆形或卵圆形，边缘整齐，底浅有弹性，由纵肌将裂底与内括约肌分开。如治疗得当，可以痊愈。

由于内括约肌常痉挛收缩，裂口供血不足，且受到粪便和肛腺分泌物的刺激、感染，使裂口边缘增厚、周围充血、底硬，可见内括约肌环肌纤维。感觉敏感，轻微刺激可引起剧烈疼痛。

裂口下端皮肤因炎症改变，浅部静脉和淋巴回流阻碍，引起水肿和纤维变性，形成结缔组织外痔。裂口上端肛门瓣和肛乳头水肿和纤维变性，形成肛乳头肥大。裂口的侧缘纤维变硬，周围组织发生脓肿，破溃到肛管，形成肛裂。裂口底部内括约肌纤维变性明显，处于痉挛状态，肛管压力增高。总之，肛裂可见到裂口、结缔组织外痔、肛窦炎、肛门梳硬结和瘘管几种病理改变。显微镜下可见肛管皮下肛窦通道、上皮样囊肿、肛腺、腺管进入平滑肌和纤维变性。

肛裂早期如果得不到及时治疗，会出现肛管溃疡（裂口纤维化，又称陈旧性肛裂）、肛乳头肥大（息肉样瘤）、哨兵痔（皮赘增生）等三种病症，继续发展还可出现肛窦炎（肛门慢性炎症）和肛裂（肛门化脓性炎症），与前三症合称“肛裂五特征”。也有因长期慢性炎性刺激成肛管癌的可能。

肛裂患者除了便血以外，经常还伴有肛门疼痛，严重者疼痛可持续数小时，十分痛苦。患者常常试图通过久忍大便，减少排便次数来减轻痛苦，结果反因粪便在大肠中停留时间延长，水分被重吸收而变得更干硬，再次排便时对肛裂创口的刺激更大，可引起更剧烈的疼痛。

预防肛裂的关键是解决便秘。一直以来，饮水疗法是防止便秘最有效而价廉的方法。按成年人的生理需要，每天摄入的液体量应达到2000-3000毫升，这在秋季气候干燥时显得格外重要。饮用的可以是白开水、淡盐水、蜂蜜冲水和饭前饭后的汤水。不宜过多饮用浓茶或含咖啡因的饮料。

因茶叶中的鞣酸可以收敛涩大便；而咖啡因则有利尿、加速水分丢失的作用。在饮食方面，宜多进食一些粗纤维含量高的食物，如新鲜蔬菜、水果、甘薯、麦片等。粗纤维食物能软化大便，增加排粪量，并刺激结肠蠕动。部分肛裂患者仅通过上述方法，症状即能缓解。

符合生理要求的排便时间是早晨起床或早餐后。经过一夜的消化、吸收，粪便已储留在乙状结肠。起床所产生的“起立反射”和早餐后产生的“胃结肠反射”可使结肠蠕动波增加，结肠内压增高，产生便意。此时可以不增加腹压，顺利地将粪便排出。因此，在正常生活中应合理安排好时间，养成良好的排便习惯。