脑干梗塞和脑梗塞是两种不同的疾病，它们之间存在一些区别。

首先，脑干梗塞是指由于血管阻塞导致大脑中枢神经系统受损，通常会出现头痛、眩晕、恶心、呕吐等症状。而脑梗塞则是指血管阻塞导致中枢神经系统缺氧，出现头痛、肢体麻木、视力模糊等症状。

其次，脑干梗塞的发生可能会伴随着一些其他的症状，如意识障碍、肌肉僵硬等。而脑梗塞则通常不会出现这些症状。

最后，治疗方法也有所不同。对于脑干梗塞，医生通常会使用药物来缓解症状；而对于脑梗塞，医生通常会进行手术或者介入治疗。

总之，虽然这两种疾病都是中枢神经系统受损的表现，但是它们的发生原因和治疗方法还是有所不同的。