13岁的孩子在半夜总是醒来，可能与以下原因有关：睡眠环境差、营养不良、消化问题等。

1. 睡眠环境差：孩子的睡眠环境可能不理想，例如光线太亮或噪音过大，这可能影响到他们的睡眠质量，导致半夜频繁醒来和入睡困难等问题。

2. 营养不良：孩子可能无法从日常饮食中获取足够的营养，如钙和维生素D等物质。这可能引起中枢神经系统的过度兴奋，导致睡眠不深、多汗和精神紧张等情况。

3. 消化问题：在睡前摄入过多食物、肠道菌群失衡或者腹部受凉等情况可能导致消化不良。食物无法被及时消化吸收，可能引起腹胀、恶心和呕吐等症状，从而导致13岁的孩子在半夜醒来。

此外，13岁孩子半夜醒来还可能与精神压力大和受到惊吓等原因有关。建议家长最好带孩子去儿科医院就诊，明确造成半夜醒来的具体原因，并积极接受治疗。