紧急避孕药引起的肚子疼痛持续时间因疼痛程度而异，可从以下方面进行判断：

1. 轻微疼痛：

紧急避孕药含有大量孕激素，可能对胃肠道造成刺激，导致轻微的肚子疼痛。通常情况下，疼痛程度不太严重，持续时间大约为1天左右。

2. 严重疼痛：

紧急避孕药可能导致卵巢功能减弱，影响体内雌激素水平，使子宫内膜出现异常。这可能导致月经提前出现，引起子宫收缩而导致肚子疼痛。一般来说，这种疼痛程度较为严重，可能会持续约3天左右。

如果因紧急避孕药引起身体不适，建议及时就诊。在医生的指导下，选择合适的处理措施，以避免进一步的身体不适。