中医理论认为，脏腑经络气血因各种原因导致运行不畅，可能出现瘀滞、逆乱、气机升降失常等病理改变，导致疼痛，即所谓的“不通则痛”。针灸治疗通过刺激和温煦穴位，起到疏通经脉、活血化瘀的作用，改善病变部位的气血运行状况，从而改善病痛部位的营养状态，恢复其正常生理活动，即经络通畅，脏腑恢复相对阴阳平衡。

若用西医的观点来解释针灸止痛的原理，就是通过针刺人体相应穴位，调节人体的血压、心跳、呼吸、脉搏、体温、局部电阻和血流速度等，从而使痛处的肌肉分泌相应的镇痛物质或直接解除痛处的神经传导障碍，使身体局部的淋巴细胞或白细胞迅速增加，达到消炎止痛的效果。由于针灸直接作用于相应部位，因此其疗效很快，平均起效速度在0.1到3分钟之间，甚至更快。针灸止痛的原理是调节人体自身的镇痛和免疫能力，因此对人体没有任何不良作用，其效果可以经得起任何第三方机构的检验。

从中医的角度来解释，针灸止痛的原则是要确保经络脏腑气血畅通无阻。中医认为，畅通则不痛，因此针灸以通经络为要务。经络不通的情况可以通过诊脉、诊舌、诊面色等方法确诊，然后针刺相应的腧穴，以达到疏风散寒、解肌止痉等作用。在进行针刺时，要注重固护和激发人体的正气，正气在某种程度上近似于西医的免疫能力。

针灸止痛的穴位多分布在四肢、膝肘以下，以及指、趾关节处。举例来说，有曲池、后溪、三间、少商、商阳、阳陵泉、绝骨、太溪、束骨、公孙、太冲、丘墟等穴位。在临床应用时，更多情况下要根据不同情况来辩证取穴，辩证可能涉及经络、虚实、脏腑、阴阳等方面。最忌拘泥于固定方法，否则只会用之无效，徒然贻笑天下。以上仅简略解释了列举的一些穴位，希望能够引发更多针灸爱好者的讨论与指正。