月经第三天呈黑色，可能是由于以下原因导致的：

1. 卵巢功能减退：卵巢功能减退可能会导致月经量减少，同时也可能出现褐色分泌物。

2. 子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是一种常见的妇科疾病，其中一种类型是子宫内膜癌。这种情况下，子宫内膜会长在子宫外部，形成一个大小和形状不规则的肿块。

3. 妊娠：在怀孕期间，卵巢会分泌雌激素和孕激素，这些荷尔蒙可以影响女性生殖系统的正常功能。如果女性怀孕了，她们的身体可能会产生更多的黑色分泌物。

4. 血液问题：如果女性患有某些疾病或者受到某些药物的影响，可能会导致月经量减少或者出现褐色分泌物。

总之，如果您有任何不适或疑虑，请及时咨询医生进行检查和诊断。