藿香正气水通常可以与奥美拉唑一同使用，但最好在服用它们之间留出一段时间间隔。

奥美拉唑是一种保护胃黏膜的药物，对于胃溃疡和胃炎等疾病具有一定的缓解和调整作用。而藿香正气水是一种中成药，其功效在于解表化湿、理气和中，可用于治疗感冒、呕吐、泄泻、中暑等异常病症，同时对急性肠炎也有一定改善效果。这两种药物一般没有配伍禁忌，因此可以一起服用。但是，由于藿香正气水的成分比较复杂，为避免出现不良影响，建议两种药物服用时间最好相隔一个小时。

另外，需要注意的是，藿香正气水中含有一定量的酒精。因此，如果患者对酒精过敏，应该避免使用这种药物，可以选择藿香正气软胶囊等性状不同的药物来替代。另外，奥美拉唑需要在肠道内溶解才能发挥药效，因此在服用药物时需要整粒吞服，以确保其有效性。