试管移植，即胚胎移植，可能会在第十三天出现隐隐作痛的感觉。这种疼痛可能是由于生理因素或病理因素引起的，例如先兆流产或慢性胃炎等。下面对这些情况进行具体分析：

一、生理因素：

胚胎移植通常采用体外受精的方法，将胚胎植入子宫内，以实现妊娠的目标。如果在胚胎移植第十三天感到隐隐作痛，可能是机体为了维持胚胎的正常发育，导致孕激素和雌激素水平上升而引起的，这属于正常生理现象。

二、病理因素：

1. 先兆流产：

如果在这个阶段受到饮食、环境或情绪等因素的影响，导致胚胎发育异常，可能会引发先兆流产，使子宫异常收缩，从而出现上述症状。这时候应及时前往正规的医疗机构进行保胎治疗。

2. 慢性胃炎：

幽门螺杆菌感染是慢性胃炎的主要原因之一。在这种情况下，胃肠道受炎症因子的影响，可能会引起疼痛的感觉。可以按医嘱使用蒙脱石散、奥美拉唑肠溶胶囊等药物进行治疗。

此外，胚胎移植第十三天肚子隐隐作痛可能也与十二指肠溃疡、胃溃疡、急性胃肠炎等疾病有关。建议一旦出现不适症状，及时就医寻求医生的建议。